傳統的國內跨境電子商務進口物流方式是中國境內貿易公司通過一般貿易方式將商品進口到中國境內之后，直接通過自己的電商平臺銷售，或交由其他電商平臺銷售。這是在跨境貿易電子商務服務試點推行前，絕大多數合法商家都采取的方式。除此之外，還有以下五種物流方式。
(一)旅客行李
即進出境旅客攜帶的全部行李物品。海關對行李物品的界定是自用合理數量，非以營利為目的，因此并不適合跨境電子商務。
(二)個人郵遞物品
即通過郵運渠道進出境的包裹、小包郵件以及印刷品等物品。通過郵運渠道到口岸郵局辦事處監(jiān)管清關的貨品量較大，但處理時效和服務質量有待提高。
(三)快件
即進出境快件營運人，以向客戶承諾的快速的商業(yè)運作方式承攬、承運的進出境貨物、物品，進出境快件監(jiān)管一般都有信息化系統，因此處理能力和穩(wěn)定性都比較好。
(四)跨境試點一般進口
適用于境內個人或電子商務企業(yè)通過電子商務交易平臺實現交易(保稅電商除外)，并采用“清單核放、匯總審批”模式辦理通關手續(xù)的電子商務零售進出口。此種方式清關費用比郵快件低，處理能力比郵快件穩(wěn)定。
(五)跨境試點保稅進口
這種物流方式不但因備貨倉儲在境內而運營成本較境外低，而且發(fā)貨時效快，退換貨操作方便，用戶體驗好，綜合物流成本最低。
如果采用保稅進口模式，根據海關總署《關于跨境貿易電子商務服務試點網購保稅進口模式問題的通知》，參與試點的電商、物流等企業(yè)須在境內注冊并按照現行海關管理規(guī)定進行企業(yè)注冊登記，開展相關業(yè)務，且能實現與海關等管理部門的信息系統互聯互通。
跨境電子商務進口的物流模式表現出多樣化的特點，貿易商應根據各自的需要選擇適合的物流模式?？缇畴娮由虅者M口的競爭逐步從商品的競爭向供應鏈和整體服務的競爭轉移，因此跨境試點一般進口和跨境試點保稅進口是目前跨境電子商務進口的主要物流方式。
根據海關總署相關管理規(guī)定，電子商務企業(yè)或個人通過經海關認可并且與海關聯網的電子商務交易平臺實現跨境交易進出境貨物、物品的，電子商務企業(yè)、監(jiān)管場所經營企業(yè)、支付企業(yè)和物流企業(yè)應當按照規(guī)定向海關備案，并通過電子商務通關服務平臺實時向電子商務通關管理平臺傳送交易、支付、倉儲和物流等數據。開展跨境電子商務進口，通常需要具備自營或平臺網站/網店，網站已完成網絡內容提供商(icp)備案且正常運作，與海關、商檢、電子口岸等完成對接。目前，各試點城市都推出了自己的跨境貿易電子商務平臺，如上海的跨境通、寧波的跨境購等。
跨境支付過程涉及海關的系統校對核查、用戶下單時的信息審查以及電商綜合稅的繳納等，任何一個環(huán)節(jié)出錯都會給用戶造成不良體驗，直接導致銷售損失和品牌受損。因此，跨境電子商務進口企業(yè)在選擇收款支付公司時，需要考量的因素，除了費率，更重要的是安全、合規(guī)和支付資質，建議選擇已經獲得政府主管部門準入的公司開展合作。