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定量PCR實(shí)驗(yàn)過(guò)程注意事項(xiàng)

發(fā)布時(shí)間:2024-07-12
在定量pcr(也稱(chēng)rt-pcr或qpcr)中,熒光信號(hào)是由熒光探針或熒光dna結(jié)合染料(如sybr green)產(chǎn)生,其強(qiáng)度與pcr產(chǎn)物分子(擴(kuò)增子)的數(shù)量成正比。每個(gè)循環(huán)結(jié)束時(shí),收集熒光信號(hào)強(qiáng)度,通過(guò)將熒光強(qiáng)度與循環(huán)數(shù)作圖,qpcr儀生成擴(kuò)增曲線,其表示在整個(gè)pcr過(guò)程中產(chǎn)物的累積,通過(guò)這個(gè)過(guò)程,即可實(shí)現(xiàn)量化。如果樣品中特定的序列(dna或rna)豐富,則在較早的循環(huán)中觀察到擴(kuò)增,ct值小;如果序列稀少,則在稍后的循環(huán)中觀察到擴(kuò)增,ct值大。此sop將涵蓋總rna提取和兩步法逆轉(zhuǎn)錄定量pcr(qrt pcr)的操作過(guò)程以及數(shù)據(jù)分析。
注意事項(xiàng):
1、 所有步驟均應(yīng)在超凈工作臺(tái)上進(jìn)行,超凈臺(tái)紫外照射至少15min。
2、所有試劑應(yīng)為此實(shí)驗(yàn)專(zhuān)用。
3、使用75%乙醇或其他去污劑擦拭工作臺(tái),避免表面污染。
4、 進(jìn)入熒光定量pcr 操作實(shí)驗(yàn)室后需要佩戴一次性無(wú)菌口罩、無(wú)菌乳膠手套、實(shí)驗(yàn)中盡量避免與同事交談,防止pcr 模板污染。
5、實(shí)驗(yàn)中使用各種規(guī)格的離心管,槍頭及配制試劑和溶解沉淀用的水,均應(yīng)焦碳酸二乙酯(depc)處理后使用,以去除吸附的rna酶污染。
6、 使用trizol試劑時(shí),避免接觸皮膚或衣服。避免吸入蒸氣。
7、qpcr反應(yīng)需要qpcr級(jí)水,試劑和試管。請(qǐng)務(wù)必使用正確類(lèi)型的qpcr光學(xué)pcr管和蓋子。不可用普通的pcr管。
8、加樣前,先布局,規(guī)劃加樣順序以避免交叉污染。
9、所有實(shí)驗(yàn)應(yīng)均應(yīng)設(shè)置無(wú)模板對(duì)照,其中包含除dna或cdna樣品以外的所有反應(yīng)組分。
10、先配制qpcr反應(yīng)混合液,減少誤差。
11、 加樣后上機(jī)前,務(wù)必通過(guò)瞬離將反應(yīng)液離至管底,并消除溶液中的氣泡,因?yàn)闅馀輹?huì)干擾熒光檢測(cè)且降低酶活性,從而降低擴(kuò)增效率。
關(guān)鍵詞:超凈工作臺(tái) 工作臺(tái) 膠手套
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