nibsc使用環(huán)境監(jiān)測(cè)追蹤最新的冠狀病毒變體 ay.4.2
美國(guó)國(guó)家生物標(biāo)準(zhǔn)與控制研究所（nibsc）的最新研究證實(shí)，在廢水樣品中發(fā)現(xiàn)的冠狀病毒δ亞型ay.4.2的頻率越來(lái)越高。
自大流行爆發(fā)以來(lái)，nibsc研究所的科學(xué)家一直在分析倫敦一家污水處理廠的樣本，并且先前已經(jīng)表明，環(huán)境監(jiān)測(cè)可用于測(cè)量病毒傳播水平并主動(dòng)識(shí)別令人擔(dān)憂的新變體。
nibsc通過(guò)大流行觀察到廢水樣本中變異優(yōu)勢(shì)的轉(zhuǎn)變，密切反映了臨床樣本的測(cè)序結(jié)果。2020年3月至4月，在廢水樣本中第一次觀察到變種d614在大流行的頭幾個(gè)月內(nèi)取代了全球原來(lái)的武漢毒株。.2020年11月10日，在樣本中第一次發(fā)現(xiàn)了一種新的更具傳染性的α變體，然后在2021年1月底之前頻率迅速增加，成為主要變體。這種α變體后來(lái)被各種具有免疫逃逸特性的譜系所取代，導(dǎo)致病毒傳播水平的增加。delta變體是其中最成功的，自2021年6月初以來(lái)一直占據(jù)主導(dǎo)地位（圖1a）。
figure 1.（a）在倫敦污水處理廠收集的廢水樣本中鑒定的sars-cov-2變異的分?jǐn)?shù)，基于對(duì)病毒rna基因組中關(guān)鍵尖峰基因突變的定量。（b）廢水樣品中sars-cov-2 δ亞變體ay.4.2與臨床樣品（黑線）的分?jǐn)?shù)相比，基于對(duì)病毒rna基因組中y145h尖峰基因突變的定量。顯示了每個(gè)采樣日期的重復(fù)序列的平均值 （n=12–20）。誤差線表示均值的標(biāo)準(zhǔn)誤差。數(shù)據(jù)來(lái)源：nibsc內(nèi)部數(shù)據(jù)庫(kù)2021年10月。圖1b中提到的臨床數(shù)據(jù)來(lái)自英國(guó)hhsa關(guān)注的sars-cov-2變體和在英國(guó)正在研究的變體。技術(shù)簡(jiǎn)報(bào) 26.衛(wèi)生和社會(huì)護(hù)理部，2021年。
最近的結(jié)果表明，nibsc的科學(xué)家已經(jīng)能夠檢測(cè)到從7月初開(kāi)始存在于污水中的最新delta亞變體ay.4.2，然后穩(wěn)步增加并達(dá)到21個(gè)樣本中病毒序列的8%左右。
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