隨著單分子熒光原位雜交(single molecule fluorescent in situ hybridization,smfish)以及rnascope技術(shù)的發(fā)展，曾經(jīng)僅用來觀察細(xì)胞組織形態(tài)的大腦切片在神經(jīng)領(lǐng)域科學(xué)家們的手中已經(jīng)可以為我們展現(xiàn)單細(xì)胞水平豐富多彩的基因表達(dá)了。就像這樣一切二標(biāo)三成像四分析五測序：
描繪大腦皮層單細(xì)胞基因表達(dá)的自動化流水線
但一直以來，高內(nèi)涵的粉絲們腦袋里面一定都是：我們高內(nèi)涵哥哥速度超快，通量超高，表型篩選的一把手，拍攝和分析整合得天絲無縫，孔板是哥哥的好幫手……看到切片是不是有點(diǎn)蔫兒？別著急，只要有成像和分析的地方，我們珀金埃爾默高內(nèi)涵團(tuán)的哥哥們就是妥妥的流量擔(dān)當(dāng)。
今天，我就先給大家介紹operetta cls這個靈活的小可愛是怎么受到劍橋大學(xué)神經(jīng)科學(xué)家們的青睞的。
8色高能光源，12濾光片帶寬可選，五顏六色都可行：
中下丘腦中間隆起(me)的少突膠質(zhì)細(xì)胞smfish聯(lián)合酪胺信號放大技術(shù)(tsa)六色成像
水鏡的力量，更大的通光量，更好的分辨率
40x水鏡下海馬區(qū)星形膠質(zhì)細(xì)胞的成像
xyz軸的智能預(yù)掃描，省時省力省空間：
人大腦切片的5x預(yù)掃描與region of interesting，roi 40x成像(dapi & smfish)
強(qiáng)大的harmony全方面分析軟件，智能的組織分區(qū)，準(zhǔn)確的神經(jīng)細(xì)胞分類，輕松的rna spot定量
harmony自學(xué)習(xí)區(qū)分組織區(qū)域及細(xì)胞分類
圍繞著快速高質(zhì)成像與深度分析定量統(tǒng)一整合的高內(nèi)涵核心，operetta cls在組織切片的成像和分析中展示出了其強(qiáng)大的能力。利用這樣的方法，僅2020年3月，以david h. rowitch 團(tuán)隊(duì)為主的劍橋大學(xué)神經(jīng)科學(xué)家們， 3號在線發(fā)表了一篇cell metabolism if: 22.415；4號在線發(fā)表了一篇neuron if：14.403；16號在線發(fā)表了一篇nature neuroscience if：21.126，還有一篇預(yù)印本等待發(fā)表。文中的圖片和方案全部來自于這些高水平文章。
所以，大家還在等什么呢，神經(jīng)領(lǐng)域，大腦切片，operetta cls，和劍橋大牛們一起，粉它！
operetta cls
參考文獻(xiàn)
1. bayraktar, o.a., et al., astrocyte layers in the mammalian cerebral cortex revealed by a single-cell in situ transcriptomic map. nat neurosci, 2020.
2. cheng, w., et al., calcitonin receptor neurons in the mouse nucleus tractus solitarius control energy balance via the non-aversive suppression of feeding. cell metab, 2020. 31(2): p. 301-312 e5.
3. smith h l, freeman o j, butcher a j, et al. astrocyte unfolded protein response induces a specific reactivity state that causes non-cell-autonomous neuronal degeneration[j]. neuron, 2020.
4. kohnke s, lam b, buller s, et al. nutritional signals rapidly activate oligodendrocyte differentiation in the adult hypothalamic median eminence[j]. biorxiv, 2019: 751198.